OAV – это одновременно и прелюдия к игре и постскриптум для полнометражки.
Первые серии OAV – прелюдия. Вы – новобранец, отобранный комиссией для стажировки на звание государственного алхимика, о чем вам и сообщается в первой серии (кстати, временами все происходит от первого лица). Затем показывается столкновение между разными группировками (армиями, бандами, школами) алхимии, а точнее битву между гомункулами и регулярной армией алхимиков. Между молотом и наковальней оказывается юный Цельнометалический алхимик со своим братом.